Baptistérium Agios Ioannis (Svatý Jan) na ostrově Kos je pozoruhodnou památkou raně křesťanského období, která svědčí o šíření křesťanství v oblasti Egejského moře již od 4.-6. století n. l. Nachází se poblíž stejnojmenného kostela Agios Ioannis, nedaleko dnešního hlavního města Kos a je jedním z nejvýznamnějších zajímavostí ostrova.
Baptistérium bylo zvláštní stavbou určenou k vykonávání křtu, jednoho z nejdůležitějších svátostí v křesťanské víře. V jeho středu se nacházela křestní nádrž - obvykle ve tvaru kříže nebo kruhu - do níž se ponořovali nově obrácení křesťané. Tento akt symbolizoval očistu od hříchu a nový začátek v duchovním životě. Architektura baptistéria Agios Ioannis nese znaky byzantského stylu s dochovanými mozaikovými podlahami, fragmenty sloupů a apsid, které naznačují vysokou úroveň řemeslného zpracování. K baptistériu často náležel i menší kostelík či kaple, kde se konala liturgie a další náboženské obřady. V některých obdobích mohla sloužit i jako místo katechizace, tedy výuky víry před samotným křtem.
Tato stavba je důležitým důkazem rozšíření a upevnění křesťanské víry na Kosu po pádu římské říše, kdy se ostrov stal součástí Byzantské říše. Současné archeologické nálezy přispívají k lepšímu pochopení náboženského a kulturního života obyvatel ostrova v období pozdní antiky a raného středověku. Baptistérium Agios Ioannis je cenným klenotem historie ostrova Kos, který přitahuje nejen věřící poutníky, ale i návštěvníky se zájmem o dějiny křesťanství.